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1999年8月，深圳市政府、北京大学、香港科技大学三方携手，在深圳高新区共同创建深港产学研基地。 深港产学研基地探索和实践官、产、学、研相结合的新路子，为深圳发展高新技术产业和提升教育事业服务，形成强大的创新科技能力及高新技术产业化能力，注入新的活力，现为北京大学和香港科技大学最重要的对外合作基地之一。 深港产学研基地的成立，实现了深港科技合作的突破，成为深港合作的一个标志。

充分发挥北京大学与香港科技大学丰富的教育资源优势，根据深港区域及珠三角地区经济社会发展的需要培养高层次人才。深港产学研基地已推出多种类、多层次、多渠道、国际化的教育培训及人才培养计划，为深港湾区乃至全国其他地区培训了大量具备全球视野、国际竞争力和先进管理理念的各类高级人才，成为深圳市重要的人才培养基地。 深港产学研基地成立以来已先后开展了包括本科生教育、研究生教育、高级研修班、论坛讲座四个方面的众多项目；北大附中在南山区建立了分校；香港科技大学自2001年起就率先也在深圳招收应届高中毕业生自费赴港就读本科；北大光华管理学院和香港科大商学院也在深港产学研基地建立分院。此外基地每年所举办的各种高层次的论坛和讲座也为深圳市民提供了丰富的精神食粮。