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兰州新区综合保税区于2014年7月15日获国务院批复，是由海关根据国家有关规定进行管理的海关特殊监管区。综合保税区有“进口保税、出口退税、区内货物自由流动”的“自由港”特点，是我国开放层次最高、优惠政策最集中、功能最齐全、手续最便捷的海关特殊监管区。 2015年8月18日，兰州新区综合保税区顺利通过由国家海关总署等10部委组成的验收组验收。 2015年8月21日，兰州新区综合保税区举行揭牌仪式，宣告封关运行。 2015年12月24日,兰州新区综合保税区举行正式封关运营新区发布会暨首单货物通关仪式。兰州新区卓尔电子有限公司600万美元的液晶屏、触摸屏等电子产品率先在兰州新区综合保税区报关、通关，拉开了兰州新区综合保税区正式封关运营的大幕。兰州新区综合保税区位于兰州新区机场东部物流产业组团，总规划面积3.39平方公里，其中围网区域面积约2.86平方公里，配套区域面积约0.53平方公里。综合保税区区位条件良好、航空、铁路及公路运输条件便利，距兰州市约45公里，距中川机场约2公里，距中马铁路货运站约12公里。 兰州新区综合保税区共分两期开发建设,一期完成功能建设，二期重点建设保税加工制造、仓储物流等功能。主要功能分区包括：出口加工区（约1.65平方公里），主要布局精细化工、高端装备制造、农产品和生物医药的出口加工型企业和电子产业；保税仓储物流区（约0.44平方公里），主要布局国际物流配送企业和进出口商品存储；口岸作业区（约0.51平方公里）以及综合服务区（约0.19平方公里）。 综合保税区纬八路、纬十路、纬十二路、纬十四路和经九路等主体道路干网已基本建成，围网选址范围内场地粗平已基本完成，主干路网水、电、气等配套管网已铺设完成。区内已签约项目9个，拟入区项目12个，在谈项目18个，计划总投资78316万美元（约47.74亿人民币），占地面积0.804平方公里，预计就业人数约7000人。 2022年12月14日，兰州新区综合保税区企业服务中心正式成立。

兰州新区综合保税区所在地——兰州新区，位于祖国陆域版图的几何中心，距连云港约1600公里，距新疆阿拉山口口岸约2500公里，距广州约2400公里，承东启西，连接南北，位置得天独厚，功能不可替代。区内又有中川国际机场，国道312线、109线以及连霍高速、京藏高速等多条公路交通干线和高速公路在此交汇，交通十分便利，特别是随着兰渝铁路、兰新铁路二线、宝兰客运专线等铁路干线的建设，兰州新区连通全国乃至中亚的枢纽作用将得到进一步强化，交通枢纽优势将更加凸显。综合保税区则位于兰州新区中间核心地段——机场东物流产业组团内，距中川机场约2公里，距中马铁路货运站约12公里，距兰州市大约38.5公里，航空、铁路及公路运输条件十分便利。